水資源的供需平衡維繫著高科技科學城的新竹都會區未來發展，而未來用水逐漸吃緊且乾旱時期水資源分配不均的問題，顯示出區域內水資源管理的重要。水資源規劃建立在對基礎水文資源的掌握，本文即以水質和水量的角度來探討頭前溪流域水資源的使用與分配。
研究對象分為地下水、河川與水圳三者。以不同用水標的為原則，河川與地下水屬生活用水與農業用水標的；而水圳則主要以農業用水標的為主。河川水質依據行政院環保署2005年1月至2006年8月的資料，以台灣河川水質指數WQI及河川污染指數RPI兩指標及乾濕季節來評估水質狀況；水圳以灌溉用水水質標準評估，採樣時間配合兩季耕作「放水」時期，分別為2006年8月及2007年3月；地下水則以灌溉用水水質標準與自來水水源標準來評估。採樣時間為反映乾溼兩季差異，以2006年8月及2007年1月為主。地下水與水圳檢測項目包括電導度（EC）、pH、溶氧（DO） (地下水除外)、鈉離子(Na+)、鉀離子(K+)、鈣離子(Ca2+)、鎂離子(Mg2+)、硫酸根離子(SO42-)、碳酸根離子(CO32-)、碳酸氫根離子(HCO3-)、氯離子(Cl-)、氨氮(NH3-N)、硝酸鹽氮(NO3-N)及懸浮固體物(SS)。
研究結果發現河川水質主要受到季節降雨量的影響，懸浮固體值為影響水質好壞最重要的參數，其次為總磷。水質在一般情況下屬良好及普通，適合一般生活用水標準；水圳水質上游優於下游，春耕時期雨水較多，水質較夏季良好，水質符合灌溉水標準。研究區淺層地下水可開發量充裕，雖已受到某種程度的汙染，不符合生活用水之標準，卻可作為生活與工業用水的調節性水源。

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