高效液相層析儀（HPLC）及高效液相層析質譜儀（LC-MS）為測定中藥指標成分的常用工具。本研究是藉由HPLC分離技術來開發辛夷及牡丹皮藥材之分析方法，並藉由LC-MS方法確認或推測各成分的結構，同時，將多批樣品的分析數據結果整理歸納，建立藥材基原與化學成分指紋圖譜間的關係。另外，不同植物含有不同種類與含量的微量元素，我們亦利用感應耦合電漿質譜儀(ICP-MS)分析辛夷不同品種間的微量元素相對含量，並應用於藥材基原之化學辨識。

本研究分三個部分，第一部分為辛夷成分之分析。辛夷能袪風散寒、通肺竅、通鼻。主治風寒頭痛、鼻塞、鼻淵及過敏性鼻炎。其內含生物鹼(1.d-coclaurine，2.magnoflorine，3.magnocurarine) 及木質酚類化合物(4.pinoresinol dimethyl ether，5. magnofargesin，6.liroresinol-B dimethyl ether，7.magnolin，8. demethoxyaschantin，9.aschantin，10. fargesin，11.denudatone，12.burchellin，13.denudatin A，14.futoenone，15.denudatin B，16.tiliroside)。以HPLC進行分析，實驗結果顯示，利用醋酸、氰甲烷及甲醇水溶液為沖提液，以280nm為偵測波長，可在75分鐘內有效分析三種市面上常見辛夷的16個成分。本研究進一步利用LC-MS以確認或推測辛夷特殊波峰的化學結構。

第二部份為辛夷之基原辨識研究及微量元素分析。市售藥材主要有望春玉蘭（Magnolia biondii Pamp.）、玉蘭（Magnolia denudata Desr.）及武當玉蘭（Magnolia sprengeri Pamp.）等三品種，本研究收集41批樣本，利用各種相同或相異成分之間含量比值的差異，進行化學指紋圖譜品種鑑別，結果發現，玉蘭無成分3.；而成分16.為武當玉蘭之特有成分，在其他二品種中則無此吸收峰存在。此外，ICP-MS分析的結果顯示，各藥材間與各品種間確實存在不同含量的特徵元素。玉蘭除了元素Ni及Sm外，其餘的微量元素總含量為最高；武當玉蘭的Ni含量遠高於其他兩品種；亦發現望春玉蘭的Sm含量為三者之冠，為其特徵。

第三部份為牡丹皮基原之化學辨識。牡丹皮是毛莨科植物（Paeonia suffruticosa Andrew）的乾燥根皮，含水解性單寧成分（2.4,6-di-galloyl glucose，6.1,2,3,6-tetra-galloyl glucose，7.1,3,4,6-tetra-galloyl glucose，8.1,2,3,4,6-penta-galloyl glucose）、acetophenones類化合物(9.paeonol)、monoterpene glycosides類化合物(5.paeoniflorin，3.oxypaeoniflorin)以及acetophenone glycosides 類化合物(4.paeonolide)，利用醋酸、甲醇水溶液為沖提液，以280nm為偵測波長，可在60分鐘內有效分析二種市面上常見牡丹皮中的9個成分。本論文收集8批西昌丹皮（Paeonia delavayi Franch）及18批川丹皮（Paeonia Suffruticosa Andrew），以HPLC分析，研究顯示，成分6.在川丹皮中有較大之吸收峰；西昌丹皮中9/5之比值< 19.9，川丹皮則為> 57；8/6之比值係西昌丹皮>20，川丹皮<9.6。

而在基原辨識方面，除用化學指紋圖譜分類外，亦使用群聚分析、區別分析及主成分分析等多變量統計方法，得到各植物品種的數字化指紋圖譜。

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