簡易檢索 / 詳目顯示

研究生: 史諭樵
論文名稱: 貳、壹、設計與合成經由金屬催化反應製備6-位取代基的尿嘧啶核苷 貳、Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase 的機制研究 叁、Ruspolinone的合成研究
指導教授: 簡敦誠
學位類別: 博士
Doctor
系所名稱: 化學系
Department of Chemistry
論文出版年: 2013
畢業學年度: 101
語文別: 中文
論文頁數: 273
中文關鍵詞: orotidine 5'-monophosphate decarboxylase6-aryluridine6-alkyluridine
論文種類: 學術論文
相關次數: 點閱:153下載:0
分享至:
查詢本校圖書館目錄 查詢臺灣博碩士論文知識加值系統 勘誤回報
  • 摘要
    本論文研究主題共分為三部分。
    第一部分主要針對 orotidine 5’-monophosphate decarboxylase (ODCase) 設計6-aryluridine 及 6-alkyluridine 衍生物,希望尋找對 ODCase 具有活性的化合物, 並做為可能的 ODCase 抑制劑及抗癌試劑。
    第一章期望利用碳-碳鍵偶合的方式,得到六位芳香環取代的產物。醣上具有保
    護基的 5-及 6-halouridine 衍生物,以 Pd(OAc)2 做為催化劑,與有機硼酸化合物進行 Suzuki-Miyaura 交叉偶合反應,再去除保護基可以得到一系列 5-及6-aryluridine 衍生物。
    第二章,我們發現合成 6-alkyluridine 衍生物的新路徑。醣上具有保護基的
    6-cyanouridine 為起始物,藉由路易士酸 ZnCl2 與烷基格林納試劑進行親核性取代反應,再去除保護基後,得到一系列 6-alkyluridine 衍生物。
    第二部分根據 ODCase 催化受質 orotidine 5’-monophosphate (OMP) 的脫羧基反應,設計一系列與 1,3-dimethyluracil-6-carboxylate 衍生物及類似物做為化學模型分子,探討在質子性溶劑及非質子性溶劑與各式反應條件,探討碳-碳鍵斷鍵反應,並由觀察到模型分子的結果推測兩種可能的酵素生化機制。
    第三部分則是使用脯胺酸形成的亞胺離子,與親核試劑進行加成反應合成出
    pyrrolidine α-位具有取代的產物,並探討其反應機制,及對天然物 Ruspolinone 與N-Methylruspolinone 進行全合成研究。

    目錄 縮寫對照表 中文摘要 英文摘要 第一章 藉由 Suzuki-Miyaura 交叉偶合反應對 6-aryluridines 的實用合成研究 . 1 1-1 緒論 ................................................................................................................ 1 1-1-1 Orotidine 5’-monophosphate decarboxylase (ODCase) 簡介 ............ 1 1-1-2 ODCase 的受質及抑制化合物 .......................................................... 3 1-1-3 應用 ...................................................................................................... 7 1-2 6-arylurdine 衍生物合成方法及文獻回顧 .................................................... 8 1-2-1 嘧啶C-5 位置的碳-碳鍵偶合反應 ..................................................... 8 1-2-1-1 Stille 偶合反應 ................................................................................ 8 1-2-1-2 Suzuki-Miyaura 交叉偶合反應 ..................................................... 10 1-2-2 嘧啶C-6 位置的碳-碳鍵接合反應 ................................................... 12 1-2-2-1 Stille 偶合反應 .............................................................................. 12 1-2-2-2 Suzuki-Miyaura 交叉偶合反應 ..................................................... 13 1-2-2-3 C-H 鍵活化的芳香環取代反應 .................................................... 14 1-2-3 最近發表相關文獻 ........................................................................... 14 1-3 研究動機 ...................................................................................................... 15 1-4 結果與討論 .................................................................................................. 16 1-4-1 Pd(PPh3)4 做為催化劑之研究 ........................................................... 16 1-4-2 Pd(OAc)2 做為催化劑之研究 ........................................................... 23 1-5 結論 ............................................................................................................... 38 1-6 實驗部分 ....................................................................................................... 38 1-6-1 分析儀器及基本實驗操作 ............................................................... 38 1-6-2 實驗步驟及光譜數據 ........................................................................ 40 1-7 參考文獻 ...................................................................................................... 80 第二章 利用6-cyanouridine 與烷基格里納試劑經由二價氯化鋅催化的親核性取 代反應合成 6-alkyluridines ....................................................................................... 85 2-1 緒論 ............................................................................................................... 85 II 2-1-1 尿嘧啶核苷衍生物的構型 ................................................................ 85 2-2 6-alkylurdine 衍生物合成方法及文獻回顧 ................................................. 88 2-2-1 利用N-glycosylation 製備六位烷基取代嘧啶化合物 .................. 88 2-2-2 6-alkylation from LDA ....................................................................... 92 2-2-3 其他合成途徑 ................................................................................... 94 2-2-4 Burylants reaction .............................................................................. 95 2-3 研究動機 ....................................................................................................... 97 2-4 結果與討論 ................................................................................................... 98 2-4-1 Vorbruggen 方法合成 6-alkyluridine .............................................. 98 2-4-2 利用強鹼移除六位氫的 alkylation ................................................. 99 2-4-3 以6-CN-1,3-DMU (2-3) 為起始物的6-alkylation ....................... 100 2-4-4 尿嘧啶核苷的6-alkylation ............................................................. 105 2-5 結論 ............................................................................................................. 115 2-6 實驗部分 ..................................................................................................... 115 2-6-1 分析儀器及基本實驗操作 .............................................................. 115 2-7 參考文獻 ..................................................................................................... 134 第三章 Orotidine 5’-Monophosphate Decarboxylase 的機制研究 ........................ 137 3-1 文獻回顧 .................................................................................................... 137 3-1-1 過去討論ODCase 反應機制的文獻 ............................................. 137 3-1-2 六號碳上的官能基團做為離去基 ................................................. 141 3-2 研究動機 .................................................................................................... 147 3-3 結果與討論 ................................................................................................ 149 3-3-1 以乙醇或水為質子性 (protic) 溶劑之脫羰基反應 ...................... 149 3-3-2 以乙醇或水做為質子性溶劑之脫羧基反應 .................................. 164 3-3-3 以乙醇或水做為質子性溶劑之脫醯胺基反應 ............................. 171 3-3-4 以 DMF 或DMSO 做為非質子性 (aprotic) 溶劑進行碳-碳鍵斷鍵 之研究 ........................................................................................................ 178 3-3-5 以 DMF 或 DMSO 做為非質子性溶劑之脫羧基反應 ............. 184 3-4 結論 ............................................................................................................ 186 3-5 實驗部分 .................................................................................................... 187 3-5-1 分析儀器及基本實驗操作 .............................................................. 187 III 3-5-2 實驗步驟及光譜數據 ...................................................................... 189 3-6 參考文獻 .................................................................................................... 212 第四章 合成 Ruspolinone 的研究 ....................................................................... 214 4-1 序論 ............................................................................................................. 214 4-2 文獻回顧 ..................................................................................................... 215 4-2-1 Strecker reaction 與 Mannich reaction ........................................... 215 4-2-2 脫羰基反應 (decarbonylation) 形成亞胺離子之應用 ................. 216 4-2-3 天然物Ruspolinone 的合成 ........................................................... 220 4-2-4 其他方法合成 α 位置具有取代基的 pyrrolidine ....................... 223 4-3 研究動機 ..................................................................................................... 228 4-4 結果與討論 ................................................................................................. 230 4-4-1 以 pyrrole 做為親核試劑之探討 ................................................. 230 4-4-2 以 indole 做為親核試劑之探討 ................................................... 233 4-4-4 不同芳香環做為親核試劑之探討 ................................................. 236 4-4-5 以苯乙酮 (acetophenone) 做為親核試劑之探討 ......................... 237 4-4-6 反應機制研究 ................................................................................. 239 4-4-6 天然物N-Methylruspolinone 與Ruspolinone 合成之探討 .......... 246 4-5、結論 .......................................................................................................... 249 4-6 實驗部分 .................................................................................................... 249 4-6-1 分析儀器及基本實驗操作 .............................................................. 249 4-6-2 實驗步驟及光譜數據 ...................................................................... 251 4-7 參考文獻 .................................................................................................... 262

    參考文獻
    1. Fukuda, M.; Nakamura, M.; Takada, T.; Yamana, K. Tetrahedron Lett. 2010, 51,
    1732-1735.
    2. Jacobsen, M. F.; Ferapontova, E. E.; Gothelf, K. V. Org. Biomol. Chem. 2009, 7,
    905-908.
    3. Wanninger-Weiss, C.; Wagenknecht, H.-A. Eur. J. Org. Chem. 2008, 64-71.
    4. Ehrenschwender, T.; Wagenknecht, H.-A. Synthesis 2008, 3657-3662.
    5. Okamoto, A.; Tainaka, K.; Unzai, T.; Saito, I. Tetrahedron2007, 63, 3465-3470.
    6. Amann, N.; Pandurski, E.; Fiebig, T.; Wagenknecht, H.-A. Chem.-Eur. J. 2002, 8,
    4877-4883.
    7. Capobianco, M. L.; Cazzato, A.; Alesi, S.; Barbarella, G. Bioconjugate Chem.
    2008, 19, 171-177.
    8. Rozners, E.; Smicius, R.; Uchiyama, C. Chem. Commun. 2005, 5778-5780.
    9. Greco, N. J.; Tor, Y. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10784-10785.
    10. Yamamoto, Y.; Seko, T.; Nemoto, H. J. Org. Chem. 1989, 54, 4734-4736.
    11. Pesnot, T.; Wagner, G. K. Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 2884-2891.
    12. Kalachova, L.; Pohl, R.; Hocek, M. Synthesis 2009, 105-112.
    13. Cahova, H.; Havran, L.; Brazdilova, P.; Pivonkova, H.; Pohl, R.; Fojta, M.; Hocek,
    M. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 2059-2062.
    14. Srivatsan, S. G.; Tor, Y. Chem.-Asian J.2009, 4, 419-427.
    15. Srivatsan, S. G.; Tor, Y. J. Am. Chem. Soc.2007, 129, 2044-2053.
    16. Haouz, A.; Vanheusden, V.; Munier-Lehmann, H.; Froeyen, M.; Herdewijn, P.;
    Van Calenbergh, S.; Delarue, M. J. Biol. Chem. 2003, 278, 4963-4971.
    17. Gutierrez, A. J.; Terhorst, T. J.; Matteucci, M. D.; Froehler, B. C. J. Am. Chem.
    Soc. 1994, 116, 5540-5544.
    18. Herdewijn, P.; Kerremans, L.; Wigerinck, P.; Vandendriessche, F.; Van Aerschot,
    A. Tetrahedron Lett. 1991, 32, 4397-4400.
    19. Wigerinck, P.; Pannecouque, C.; Snoeck, R.; Claes, P.; De Clercq, E.; Herdewijn,
    P. J. Med. Chem. 1991, 34, 2383-2389.
    20. Sadler, J. M.; Ojewoye, O.; Seley-Radtke, K. L. Nucleic Acids Symp. Ser. 2008,
    52, 571-572.
    2
    21. Western, E. C.; Daft, J. R.; Johnson, E. M., II; Gannett, P. M.; Shaughnessy, K. H.
    J. Org. Chem. 2003, 68, 6767-6774.
    22. Crisp, G. T.; Macolino, V. Synth. Commun. 1990, 20, 413-422.
    23. During the preparation of this manuscript, Van Calenbergh, et al. reported the first
    synthesis of 6-aryluridines via SuzukieMiyaura cross-coupling reaction: Nencka,
    R.; Sinnaeve, D.; Karalic, I.; Martins, J. C.; Van Calenbergh, S. Org. Biomol.
    Chem. 2010, 8, 5234-5246.
    24. Hennecke, U.; Kuch, D.; Carell, T. Synthesis 2007, 929-935.
    25. Palmisano, G.; Santagostino, M. Helv. Chim. Acta 1993, 76, 2356-2366.
    26. Palmisano, G.; Santagostino, M. Tetrahedron 1993, 49, 2533-2542.
    27. Tanaka, H.; Hayakawa, H.; Shibata, S.; Haraguchi, K.; Miyasaka, T. Nucleosides
    Nucleotides 1992, 11, 319-328.
    28. Satoh, K.; Tanaka, H.; Andoh, A.; Miyasaka, T. Nucleosides Nucleotides 1986, 5,
    461-469.
    29. Wu, W.; Ley-han, A.; Wong, F. M.; Austin, T. J.; and Millert S. M. Bioorg. Med.
    Chem. Lett.1997, 7, 2623-2628.
    30. Nakanishi, M. P.; and Wu, W. Tetrahedron Lett. 1998, 39, 6271-6272.
    31. Cui, W.; DeWitt, J. G.; Miller, S. M.; and Wu, W. Biochem. Biophy. Res. Commun.
    1999, 259, 133-135.
    32. Feng, W. Y.; Austin, T. J.; Chew, F.; Gronert, S.; and Wu, W. Biochemistry 2000,
    39, 1778-1783.
    33. Bello, A. M.; Poduch, E.; Fujihashi, M.; Amani, M.; Li, Y.; Crandall, I.; Hui, R.;
    Lee, P. I.; Kain, K. C.; Pai, E. F.; and Kotra, L. P. J. Med. Chem. 2007, 50,
    915-921.
    34. Poduch, E.; Wei, L.; Pai, E. F.; and Kotra, L. P. J. Med. Chem. 2008, 51,432-438.
    35. Bello, A. M.; Poduch, E.; Liu, Y.; Wei, L.; Crandall, I.; Wang, X.; Dyanand, C.;
    Kain, K. C.; Pai, E. F.; and Kotra, L. P. J. Med. Chem. 2008, 51,439-448.
    36. Haraguchi, K.; Shimada, H.; Tanaka, H.; Hamasaki, T.; Baba, M.; Gullen, E. A.;
    Dutschman, G. E.; and Cheng, Y. C. J. Med. Chem. 2008, 51,1885-1893.
    37. Bell, J. B.; and Jones, M. E. J. Biol. Chem. 1991, 266, 12662-12667.
    38. Radzicka, A., Wolfenden, R. Science 1995, 267, 90-93.
    3
    39. Beak, P.; and Siegel, B. J. Am. Chem. Soc.1976, 98, 3601-3606.
    40. Lieberman, I.; Kornberg, A.; and Simms, E. S. J. Biol. Chem. 1955, 215, 403-415.
    41. Levine, H. L.; Brody, R. S.; and Westheimer, F. H. Biochemistry 1980, 19,
    4993-4999.
    42. Miller, B. G.; Snider, M. J.; Wolfenden, R.; and Short, S. A. J. Biol. Chem. 2001,
    276, 15174-15176.
    43. Shostak, K.; and Jones, M. E. Biochemistry 1992, 31, 12155-12161.
    44. Silverman, R. B.; and Groziak, M. P. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 6434-6439.
    45. Fujihashi, M.; Bello, A. M.; Poduch, E.; Wei, L.; Annedi, S. C.; Pai, E. F.; and
    Kotra, L. P. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15048-15050.
    46. Poduch, E.; Bello, A. M.; Tang, S.; Fujihashi, M.; Pai, E. F.; and Kotra, L. P. J.
    Med. Chem. 2006, 49, 4937-4945.
    47. Meza-Avina, M. E.; Wei,L.; Liu, Y.; Poduch, E.; Bello, A. M.; Mishra, R. K.; Pai,
    E. F.; Kotra, L. P. Bioorg. Med. Chem. 2010, 18, 4032-4041.
    48. Morrey, J. D.; Smee, D. F.; Sidwell, R. W.; Tseng, C. Antiviral Res. 2002, 55,
    107-116.
    49. Cernova, M.; Pohl, R.; Hocek M. Eur. J. Org. Chem.2009, 3698-3701.
    50. Kogler, M.; Jonghe, S. D.; Herdewijn, P. Tetrahedron Lett. 2012, 53, 253-255.
    51. Casalnuovo, A. L.; Calabrese, J. C. J. Am. Chem. Soc.1990, 112, 4324-4330.
    52. Amann, N.; Wagenknecht, H. A. Synlett 2002, 5, 687-691.
    53. Tapolcsanyi, P.; Krajsovszky, G.; Ando, R.; Lipcsey, P.; Horvath, G.; Matyus, P.;
    Riedl, Z.; Hajo, G.; Maesd, B. U. W.;Lemiere, G. L. F.Tetrahedron 2002, 58,
    10137-10143.
    54. Hayakawa, H.; Tanaka, H.; Maruyama, Y.; Miyasaka, T. Chem. Lett. 1985,
    1401-1404.
    55. Yoshimura, Y.; Kumamoto, H.; Baba, A.; Takeda, S.; Tanaka, H. Org. Lett. 2004,
    6, 1793-1795.
    56. Yoshimura, Y.; Yamazaki, Y.; Wachi, K.; Satoh, S.; Takahata, H. Synlett 2007,
    111-114.
    57. Fujihashi, M.; Bello, A. M.; Poduch, E.; Wei, L. H.; Annedi, S. C.; Pai, E. F.;
    Kotra, L. P. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15048-15050.
    4
    58. Dewey, T. M.; Zyzniewski, M. C.; Eaton, B. E. Nucleosides Nucleotides 1996, 15,
    1611-1617.
    59. Bhuyan, P. J.; Borah, H. N.; Sandhu, J. S. J. Chem. Soc.Perkin Trans.I 1999,
    3083-3084.
    60. Saito, I.; Ikehira, H.; Matsuura, T. J. Org. Chem. 1986, 51, 5148-5153.
    61. Hirota, K.; Kitade, Y.; Isobe, Y.; Maki, Y. Heterocycles 1987, 26, 355-358.
    62. Zhang, X.; Bernet, B.; Vasella, A. Helvetica Chimica Acta 2006, 89, 2861-2917.
    63. Kittaka, A.; Kato, H.; Tanaka, H.; Nonaka, Y.; Amano, M.; Nakamura, K. T.;
    Miyasaka, T.Tetrahedron 1999, 55, 5319-5344.
    64. Yoshimura, Y.; Kumamoto, H.; Baba, A.; Takeda, S.; Tanaka, H. Org. Lett. 2004,
    6, 1793-1795.
    65. Yoshimura, Y.; Yamazaki, Y.; Wachi, K.; Satoh, S.; Takahata, H. Synlett 2007,
    2007, 0111-0114.
    66. Tanaka, H.; Nasu, I.; Miyasaka, T. Tetrahedron Lett. 1979, 20, 4755-4758.
    67. Heinrich, D.; Diederichsen, U.; Rudolph, M. G. Chem. Eur. J. 2009, 15,
    6619-6625.
    68. Benhida, R.; Blanchard, P.; Fourrey, J.-L. Tetrahedron Lett. 1998, 39, 6849-6852.
    69. Pesnot, T.; Wagner, G. K. Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 2884-2891.
    70. Still, W. C.; Kahn, M.; Mitra, A. J. Org. Chem. 1978, 43, 2923-2925.

    無法下載圖示 本全文未授權公開
    QR CODE