簡易檢索 / 詳目顯示

回結果列表
研究生： 蔡佩樺
論文名稱： 壹、5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine 的合成研究 貳、經由脫羧基 Mannich 反應合成2-(Aroylmethylene)pyrrolidine 衍生物
指導教授： 簡敦誠
學位類別： 碩士
Master
系所名稱： 化學系
Department of Chemistry
論文出版年： 2013
畢業學年度： 101
語文別： 中文
論文頁數： 101
中文關鍵詞： 5hmdC 、2-(aroylmethylene)pyrrolidine
論文種類： 學術論文
相關次數： 點閱：155  下載：0 
分享至:
查詢本校圖書館目錄 查詢臺灣博碩士論文知識加值系統 勘誤回報

    • 本篇論文主要有兩個部份，第一部份為 5-hydroxymethyl-2’-deoxycytidine 的合成研究。我們成功地經由 Baylis-Hillman 反應，在嘧啶類核苷鹼基的 5-位置引進 hydroxymethyl 基團，包含尿嘧啶和胞嘧啶。但此反應卻只可應用於 uridine上，合成 5-hydroxymethyluridine 的衍生物。我們企圖應用於cytidine來合成 5-hydroxymethylcytidine 的衍生物，但此方法並無法成功得到。
    第二部份是研究合成 2-(aroylmethylene)pyrrolidine 的衍生物。我們發現 N-benzylproline 可和具有乙醯基取代的不同芳香環化合物進行脫羧基 Mannich 反應。於此，研究了此反應的應用性，而製備一系列 2-(aroylmethylene)pyrrolidine 的衍生物。

    藥品試劑縮寫對照表 I Abstract III 摘要 IV Chapters I.Introduction 1 II.Literature reviews and synthesis of the 5-hydroxymethyl-2’-deoxycytidine derivatives 2-1.Literature reviews 2 2-2.Synthesis of containing 5-hydroxymethylcytosine and 5-hydroxymethyluracil derivatives 9 2-3.The various detection methods of motified cytosine in DNA 19 III.Design and synthesis of 5-hydroxymethyl-2’-deoxycytidine 3-1.Results and discussion 22 3-1-1.Synthesis of 5-hydroxymethyluracil 23 3-1-2.Synthesis of 5-hydroxymethylcytosine and its nucleosides 24 3-1-3.The glycosylation of thymine、5-hydroxymethyluracil and 5-protected hydroxymethyluracil 28 3-1-4.Synthesis of 5-formyl-2’-deoxyuridine and derivatives 33 3-1-5.Synthesis of motified 5-hydroxymethyluridine 36 3-2.Conclusion 39 IV.Introduction 40 V.Literature reviews and the research motive 42 VI.Site-specific functionalization of α-amino acid skeletons using various nucleophiles 6-1.Results and discussion 46 6-1-1.The review of starting materials 46 6-1-2.The decarboxylative coupling of N-benzylproline with containing nitrogen aromatic nucleophiles 48 6-1-3.The decarboxylative coupling of proline with aromatic methyl ketones 53 6-1-4.The investigation of N-benzylproline with diketones in the decarboxylative coupling 62 6-2.Conclusion 65 VII.Instrumentation, experiment section 7-1.General experiment processing 66 7-2.Instrumentation 67 7-3.Experiment steps 68 VIII.References 95

    1. (a) Miranda, T. B.; Jones, P. A. J. Cell. Physiol. 2007, 213, 384-390. (b) Chow, J. C.; Yen, Z.; Ziesche, S. M.; Brown, C. J. Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2005, 6, 69-92; (c) Morison, I. M.; Ramsay, J. P.; Spencer, H. G. Trends Genet. 2005, 21, 457-465.
    2. Ladwein, K. I.; Jung, M. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 12143-12145.
    3. Hotchkiss, R. D. J. Biol. Chem. 1948, 175, 315-332.
    4. Bestor, T. H. Gene. 1988, 74, 9-12.
    5. Goll, M. G.; Bestor, T. H. Annu. Rev. Biochem. 2005, 74, 481-514.
    6. Wu, S. C.; Zhang, Y. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010, 11, 607-620.
    7. Feinberg, A. P.; Vogelstein, B. Nature. 1983, 301, 89-92.
    8. Kriaucionis, S.; Heintz, N. Science. 2009, 324, 929-930. (b) Tahiliani, M. et al. Science. 2009, 324, 930-935.
    9. Booth, M. J.; Branco, M. R.; Ficz, G.; Oxley, D.; Krueger, F.; Reik, W.; Balasubramanian, S. Science. 2012, 336, 934-937.
    10. Yu, M.; Hon, G. C.; Szulwach, K. E.; Song, C.-X.; Zhang, L.; Kim, A.; Li, X.; Dai, Q.; Shen, Y.; Park, B.; Min, J.-H.; Jin, P.; Ren, B.; He, C. Cell. 2012, 149, 1368-1380.
    11. Raiber, E.-A.; Beraldi, D.; Ficz, G.; Burgess, H. E.; Branco, M. R.; Murat, P.; Oxley, D.; Booth, M. J.; Reik, W.; Balasubramanian, S. Genome Biol. 2012, 13, R69.
    12. (a) Globisch, D.; Münzel, M.; Müller, M.; Michalakis, S.; Wagner, M.; Koch, S.; Bruckl, T.; Biel, M.; Carell, T. PLoS One. 2010, 5, e15367. (b) Münzel, M.; Globisch, D.; Carell, T. Angew. Chem. 2011, 123, 6588-6596; Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 6460-6468.
    13. Pfaffeneder, T.; Hackner, B.; Truβ, M.; Münzel, M.; Müller, M.; Deiml, C. A.; Hagemeier, C.; Carell, T. Angew. Chem. 2011, 123, 7146-7150; Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 7008-7012.
    14. (a) Ito, S.; Shen, L.; Dai, Q.; Wu, S. C.; Collins, L. B.; Swenberg, J. A.; He, C.; Zhang, Y. Science. 2011, 333, 1300-1303. (b) He, Y. F.; Li, B. Z.; Li, Z.; Liu, P.; Wang, Y.; Tang, Q.; Ding, J.; Jia, Y.; Chen, Z.; Li, L.; Sun, Y.; Li; X.; Dai, Q.; Song, C. X.; Zhang, K.; He, C.; Xu, G. L. Science. 2011, 333, 1303-1307.
    15. (a) Chahrour, M.; Jung, S. Y.; Shaw, C.; Zhou, X.; Wong, S. T.; Qin, J.; Zoghbi, H. Y. Science. 2008, 320, 1224-1229. (b) Clouaire, T.; Stancheva, I. Cell. Mol. Life Sci. 2008, 65, 1509-1522.
    16. Kriaucionis, S.; Heintz, N. Science. 2009, 324, 929-930.
    17. Tahiliani, M.; Koh, K. P.; Shen, Y.; Pastor, W. A.; Bandukwala, H.; Brudno, Y.; Agarwal, S.; Iyer, L. M.; Liu, D. R.; Aravind, L.; Rao, A. Science. 2009, 324, 930-935.
    18. Sugizaki, K.; Ikeda, S.; Yanagisawa, H.; Okamoto, A. Org. Biomol. Chem., 2011, 9, 4176-4181.
    19. Shapiro, R.; Servis, R. E.; Welcher, M. J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 422-424; Hayatsu, H.; Wataya, Y.; Kai, K. J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 724-726.
    20. Frommer, M.; McDonald, L. E.; Millar, D. S.; Collis, C. M.; Watt, F.; Grigg, G. W.; Mollo, P. L.; Paul, C. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1992, 89, 1827-1831.
    21. Huang, Y.; Pastor, W. A.; Shen, Y.; Tahiliani, M.; Liu, D. R.; Rao, A. PLoS One, 2010, 5, e8888.
    22. Ghosh, C.; Schmidt, D. G.; Pal, B. C. J. Org. Chem. 1984, 49, 5256-5257.
    23. Schiesser, S.; Hackner, B.; Pfaffeneder, T.; Müeller, M.; Hagemeier, C.; Truss, M.; Carell, T.; Angew. Chem. 2012, 124, 6622-6626; Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 6516-6520.
    24. Schüler, P.; Miller, A. K. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 10704-10707.
    25. Muenzel, M.; Globisch, D.; Brueckl, T.; Wagner, M.; Welzmiller, V.; Michalakis, S.; Mueller, M.; Biel, M.; Carell, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5375-5377.
    26. Loenarz, C.; Schofield, C. J. Chem. Biol. 2009, 16, 580-583.
    27. Hansen, A. S.; Thalhammer, A.; El-Sagheer, A. H.; Brown, T.; Schofield, C. J. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011, 21, 1181-1184.
    28. de Kort, M.; de Visser, P. C.; Kurzeck, J.; Meeuwenoord, N. J.; van der Marel, G. A.; Rüger, W.; van Boom, J. H. Eur. J. Org. Chem. 2001, 2001, 2075-2082.
    29. Shiau, G. T.; Schinazi, R. F.; Chen, M. S.; Prusoff, W. H. J. Med. Chem. 1980, 23, 127-133.
    30. Baker, B. R.; Schwan, T. J.; Santi, D. V. J. Med. Chem. 1966, 9, 66-72.
    31. Song, C.-X.; Szulwach, K. E.; Fu, Y.; Dai, Q.; Yi, C.; Li, X.; Li, Y.; Chen, C.H.; Zhang, W.; Jian, X.; Wang, J.; Zhang, L.; Looney, T. J.; Zhang, B.; Godley, L. A.; Hicks, L. M.; Lahn, B. T.; Jin, P.; He, C. Nat. Biotechnol. 2011, 29, 68-72.
    32. Dai, Q.; Song, C. X.; Pan, T.; He, C. J. Org. Chem. 2011, 76, 4182-4188.
    33. Sowers, L. C.; Beardsley, G. P. J. Org. Chem. 1993, 58, 1664-1665.
    34. Conte, M. R.; Galeone, A.; Avizonis, D.; Hsu, V. L.; Mayol, L.; Kearns, D. R. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1992, 2, 79-82.
    35. Crouch, G. J.; Eaton, B. E. Nucleoside Nucleotide. 1994, 13, 939-944.
    36. Grover, R. K.; Pond, S. J. K.; Cui, Q.; Subramaniam, P.; Case, D. A.; Millar, D. P.; Wentworth, P. Jr. Angew. Chem. 2007, 119, 2897-2901.
    37. Münzel, M.; Globisch, D.; Brückl, T.; Wagner, M.; Welzmiller, V.; Michalakis, S.; Müller, M.; Biel, M.; Carell, T. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 5375-5377.
    38. Okamoto, A.; Tainaka, K.; Kamei, T.; Org. Biomol. Chem., 2006, 4, 1638-1640.
    39. Okamoto, A. Org. Biomol. Chem., 2009, 7, 21-26.
    40. Sugizaki, K.; Ikeda, S.; Yanagisawa, H.; Okamoto, A. Org. Biomol. Chem., 2011, 9, 4176-4181.
    41. Umemoto, T.; Okamoto, A. Org. Biomol. Chem., 2008, 6, 269-271.
    42. Globisch, D.; Münzel, M.;Müller, M.; Michalakis, S.; Wagner, M.; Koch, S.; Brückl, T.; Biel, M.; Carell, T. PLoS ONE. 2010, 5, e15367.
    43. Hwang, C. H.; Park, J. S.; Won, J. H.; Kim, J. N.; Ryu, E. K. Arch Pharm Res. 1992, 15, 69-72.
    44. S. K. Ooi; T. H. Bestor. Cell. 2008, 133, 1145 – 1148; M. R. Branco; G. Ficz; W. Reik; Nat. Rev. Genet. 2012, 13, 7-13.
    45. Münzel, M.; Lischke, U.; Stathis, D.; Pfaffeneder, T.; Gnerlich, F. A.; Deiml, C. A.; Koch, S. C.; Karaghiosoff, K.; Carell, T. Chem.;Eur. J. 2011, 17, 13782-13788.
    46. C. Popp;W. Dean; S. Feng; S. J. Cokus; S. Andrews; M. Pellegrini; S. E. Jacobsen; W. Reik. Nature. 2010, 463, 1101-1105.
    47. M.Wossidlo; J. Arand; V. Sebastiano; K. Lepikhov; M. Boiani; R. Reinhardt; H. Scholer; J.Walter. EMBO J. 2010, 29, 1877-1888.
    48. P. Hajkova; S. J. Jeffries; C. Lee; N. Miller; S. P. Jackson; M. A. Surani. Science. 2010, 329, 78-82.
    49. S. Cortellino; J. Xu; M. Sannai; R. Moore; E. Caretti; A. Cigliano; M. Le Coz; K. Devarajan; A. Wessels; D. Soprano; L. K. Abramowitz; M. S. Bartolomei; F. Rambow; M. R. Bassi; T. Bruno; M. Fanciulli; C. Renner; A. J. Klein-Szanto; Y. Matsumoto; D. Kobi; I. Davidson; C. Alberti; L. Larue; A. Bellacosa. Cell. 2011, 146, 67-79.
    50. J. A. Smiley M. Kundracik; D. A. Landfried; V. R. Barnes Sr.; A. A. Axhemi. Biochim. Biophys. Acta Gen. Subj. 2005, 1723, 256-264.
    51. Guo, P.; Yan, S. Y.; Hu, J. L.; Xing, X. W.; Wang, C. C.; Xu, X. W.; Qiu, X. Y.; Ma, W.; Lu, C. J.; Weng, X. C.; Zhou. X. Org. Lett. 2013, 15, 3266-3269.
    52. Tardy-Planechaud, S.; Fujimoto, J.; Lin, S. S.; Sowers, L. C. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 553-559.
    53. Münzel, M.; Globisch, D.; Trindler, C.; Carell, T. Org. Lett. 2010, 12, 5671-5673.
    54. Dai, Q.; He, C. Org. Lett. 2011, 13, 3446-3449.
    55. Dai, Q.; He, C. Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry; John Wiley & Sons, Inc.: 2001.
    56. Steigenberger, B.; Schiesser, S.; Hackner, B.; Brandmayr, C.; Laube, S. K.; Steinbacher, J.; Pfaffeneder, T.; Carell. T. Org. Lett. 2013, 15, 366-369.
    57. Jäger, S.; Rasched, G.; Kornreich-Leshem, H.; Engeser, M.;Thum, O.; Famulok, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15071-15082.
    58. Kuwahara, M.; Nagahima, J.; Hasegawa, M.; Tamura, T.; Kitagata, R.; Hanawa, K.; Hososhima, S.; Kasamatsu, T.; Ozaki, H.; Sawai, H. Nucleic Acids Res. 2006, 34, 5383-5394.
    59. Shoji, A.; Hasegawa, M.; Hososhima, S.; Kuwahara, M.; Ozaki, H.; Sawai, H. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007, 17, 776-779.
    60. Hwang, C. H.; Park, J.S.; Won, J.H; Kim, J.N.; Ryu, E.K. Arch Pharm Res. 1992, 15: 69-72.
    61. Globisch, D.; Münzel, M.;Müller, M.; Michalakis, S.; Wagner, M.; Koch, S.; Brückl, T.; Biel, M.; Carell, T. PLoS ONE. 2010, 5, e15367.
    62. Ludwig, J.; Eckstein, F. J. Org. Chem. 1989, 54, 631-635.
    63. Caton-Williams, J.; Smith, M.; Carrasco, N.; Huang, Z. Org. Lett. 2011, 13, 4156-4159.
    64. Hudson, R. H. E.; Liu, Y.; Wojciechowski, F. Can. J. Chem. 2007, 85, 302-312.
    65. Vorbrüggen, H.; Hofle, G. Chem. Ber. 1981,114, 1256-1268.
    66. Itahara, T.; Ebihara, R.; Fujii, Y.; Tada, M.; Chemistry Letters. 1986, 15, 8, 1319-1322.
    67. (a) Strecker, A. Liebigs Ann. Chem. 1862, 123, 363-365. (b) Schönberg, A.; Moubasher, R. Chem. Rev. 1952, 50, 261-277.
    68. Cohen, N.; Blount, J. F.; Lopresti, R. J.; Trullinger, D. P. J. Org. Chem. 1979, 44, 4005-4007.
    69. (a) Myers, A. G.; Tanaka, D.; Mannion, M. R. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11250–11251. (b) Tanaka, D.; Myers, A. G. Org. Lett. 2004, 6, 433–436. (c) Tanaka, D.; Romeril, S. P.; Myers, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10323–10333.
    70. (a) Goossen, L. J.; Deng, G.; Levy, L. M. Science 2006, 313, 662–664. (b) Gooβen, L. J.; Rodriguez, N.; Melzer, B.; Linder, C.; Deng, G.; Levy, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4824–4833. (c) Goossen, L. J.; Rudolphi, F.; Oppel, C.; Rodriguez, N. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 3043–3045. (d) Goossen, L. J.; Zimmermann, B.; Knauber, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 7103–7106.
    71. (a) Rayabarapu, D. K.; Tunge, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13510–13511. (b) Waetzig, S. R.; Rayabarapu, D. K.; Weaver, J. D.; Tunge, J. A. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 4977–4980. (c) Burger, E. C.; Tunge, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10002–10003. (d) Waetzig, S. R.; Tunge, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4138–4139. (e) Waetzig, S. R.; Tunge, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14860–14861. (f) Weaver, J. D.; Tunge, J. A. Org. Lett. 2008, 10, 4657–4660.
    72. Bi, H. P.; Chen, W. W.; Liang, Y. M.; Li, C. J. Org. Lett. 2009, 11, 3246-3249.
    73. Bi, H. P.; Zhao, L.; Liang, Y. M.; Li, C. J. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 792 –795.
    74. Zhang, C.; Seidel, D. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1798–1799.
    75. Rithner, C.D.; Bunge, R.H.; Bloem, R. J.; C. French, J.C.; Xu, C.; Clardy, J. J. Org. Chem. 1987, 52, 298-300.
    76. Fu, L.; Gribble, G. W. Tetrahedron Lett. 2008, 49, 7352–7354.
    77. Okabe, M.; Sun, R.C. Tetrahedron. 1995, 51, 1861-1866.
    78. Bergauer, M., Hübner, H., Gmeiner, P. Tetrahedron. 2004, 60, 1197-1204.
    79. Cornforth, J.; Du, M. H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1. 1990, 1463-1467.
    80. Chen, Y. C. Facile Synthesis of 4-Arylidene-5-imidazolinones as Synthetic Analogs of Fluorescent Protein Chromophore; M. Sc. Thesis, National Taiwan Normal University, 2011.
    81. Han, Z. J.; Wang, R.; Zhou, Y. F.; Liu, L. Eur. J. Org. Chem. 2005, 934–938.
    82. Aurelio, L.; Box, J. S.; Brownlee, R. T. C.; Hughes, A. B.; Sleebs, M. M. J. Org. Chem. 2003, 68, 2652–2667.

    無法下載圖示 本全文未授權公開
    QR CODE